จากกรณีการชุมนุมประท้วงของกลุ่มแนวร่วมประชาธิปไตยต่อต้านเผด็จการแห่งชาติ หรือ นปช. ซึ่งเริ่มเมื่อต้นเดือนมีนาคม 2553  ณ สะพานผ่านฟ้าลีลาศ ถนนราชดำเนินนอก   สำนักงานบรรเทาทุกข์ฯ ได้ส่งหน่วยแพทย์ไปปฏิบัติงานช่วยเหลือร่วมกับศูนย์ปฏิบัติการทางการแพทย์ในสถานการณ์ฉุกเฉิน หรือศูนย์เอราวัณ ตั้งแต่วันที่ 12 มีนาคม 2553 โดยมีนายแพทย์พิชิต ศิริวรรณ รองผู้อำนวยการสำนักงานบรรเทาทุกข์ฯ เป็นหัวหน้าทีม ได้ส่งทีมทั้งหมด 17 ทีม ปฏิบัติงาน 3 ผลัด ตลอด 24 ชั่วโมง     ณ โรงพยาบาลมิชชั่น จนกระทั่งการชุมนุมทวีความรุนแรงขึ้นเรื่อยๆ จากสะพานผ่านฟ้ามาถึงสี่แยกราชประสงค์ และลุกลามไปถึงถนนพระราม1  ถนนราชดำริ   บริเวณรอบอนุสาวรีย์รัชกาลที่ 6   แยกศาลาแดง  และถนนพระราม 4 ตั้งแต่คลองเตยจนถึงสามย่าน  การชุมนุมปะทะกันระหว่างผู้ชุมนุมและทหาร มีการยิงปืน ปาระเบิด จุดไฟเผายางรถยนต์ในที่สาธารณะ  เผารถโดยสารประจำทาง และเผาอาคารสถานที่ต่างๆ ทั่วกรุงเทพมหานคร  จนในที่สุดความสูญเสียก็เกิดขึ้นกับทุกฝ่าย โดยสรุปตั้งแต่วันที่ 10 เมษายน-23 พฤษภาคม 2553 มีผู้บาดเจ็บ1,407 ราย และเสียชีวิต 86 ราย ข้อมูลจากศูนย์บริการการแพทย์ฉุกเฉิน กรุงเทพมหานคร (ศูนย์เอราวัณ)   

          สำนักงานบรรเทาทุกข์ฯ ได้รับมอบหมายจากศูนย์เอราวัณ และสถาบันการแพทย์ฉุกเฉินแห่งชาติ ให้เป็นผู้บัญชาการเหตุการณ์การเคลื่อนย้ายผู้บาดเจ็บจากจุดเกิดเหตุไปยังโรงพยาบาลต่างๆ ที่เหมาะสมโดยดูแลทางด้านทิศใต้ของถนนราชดำเนินนอก และทางด้านทิศใต้ของสี่แยกราชประสงค์ ได้แก่ถนนราชดำริ และถนนอังรีดูนังต์จรดถนนพระราม 4 โดยมีหน่วยงานที่มาอยู่ให้การดูแล ได้แก่ รถพยาบาลของโรงพยาบาลศิริราช โรงพยาบาลรามาธิบดี โรงพยาบาลในจังหวัดสมุทรสาคร  สมุทรสงคราม  นครปฐม  ราชบุรี  ประจวบคีรีขันธ์ และมูลนิธิร่วมกตัญญู        

          วันที่ 16 พฤษภาคม 2553 สำนักงานบรรเทาทุกข์ฯ ได้รับการประสานร้องขอจากเจ้าหน้าที่กรุงเทพมหานคร และรัฐบาล ให้เข้าไปมอบอาหารและสิ่งของจำเป็นให้แก่เด็กและผู้อ่อนแอในวัดปทุมวนารามราชวรวิหาร รวมถึงพระภิกษุและศิษย์วัดในวันที่ 17 พฤษภาคม 2553 จำนวน 500 ชุด ภายใต้การประสานงานและกำกับดูแลของเจ้าหน้าที่ตำรวจชั้นผู้ใหญ่ที่ได้รับมอบหมายจากศูนย์อำนวยการแก้ไขสถานการณ์ฉุกเฉิน หรือ ศอฉ.  ทั้งนี้ได้รับความเห็นชอบจากแกนนำ นปช. ด้วย

          เช้าวันที่ 18 พฤษภาคม 2553 ได้เข้าไปมอบเครื่องอุปโภค-บริโภค จำนวน 500 ชุด ให้แก่ชาวเคหะชุมชนบ่อนไก่ ที่ถูกปิดล้อมจากการปะทะต่อสู้โดยรอบบริเวณ และบ่ายในวันเดียวกัน ได้ร่วมกับ ม.ร.ว.สุขุมพันธุ์ บริพัตร ผู้ว่าราชการกรุงเทพมหานคร เข้าไปมอบเครื่องบริโภคอีก 2,100 ชุด ให้แก่ประชาชนในเคหะชุมชนบ่อนไก่  ชุมชนกุหลาบแดง และชุมชนซอยพระเจน สวนลุมพินี  จนกระทั่งเหตุการณ์ได้สงบลงเมื่อวันที่ 23 พฤษภาคม 2553